为贯彻落实中央推进简政放权有关精神，切实规范渔船管理、方便渔民群众，自2016年1月1日起，农业部全面推进内陆渔船“三证合一”改革，同步启用全国内陆渔船动态管理系统换发内陆渔船“三证合一”证书。截至2016年6月底，已有181861艘渔船完成数据清理并导入了全国渔船数据库，114419艘渔船换发了“三证合一”证书，分别占内陆机动渔船总数的50.8％、32％。

我国内陆渔船数量大，多为小型渔船，长期以来，由于基础薄弱，制度不健全，管理手段落后，导致内陆渔船数据和证书证件不统一、不规范。为此，2014年农业部在广泛调研的基础上，组织研发全国内陆渔船动态管理系统，合并内陆渔船检验证书、登记证书和捕捞许可证为一本“内陆渔业船舶证书”（简称“三证合一”），并在安徽、河南、新疆和山东等4省区开展试点，取得了阶段性成果。2015年年底，农业部印发公告，公布了内陆渔船“三证合一”证书样式，并下发了《加快推进内陆渔业船舶证书“三证合一”改革 做好新版证书换发有关工作的通知》，对全面推进内陆渔船“三证合一”改革工作进行了具体部署。通过实施“三证合一、一船一码”，同步推广应用全国内陆渔船管理系统，实现了内陆渔船“一表申请、一窗受理、一套数据、一个印章和一本证书”的“五个一”管理模式，切实打破了数据藩篱，加快了信息资源开放共享，推动了渔政、渔港监督和渔船检验部门间的横向联通，促进了中央与地方的纵向贯通，内陆渔船的有效监管能力得到了大幅提升。同时，由于简化了办证程序，减少了证书数量，受到了渔民群众的欢迎。

为将全国内陆渔船“三证合一”改革各项工作措施落到实处，农业部专门成立“三证合一”改革推进工作督导组，对湖南、江西、湖北、四川等重点内陆省进行了督导，目前各项工作推进顺利。